首先，患有巧克力囊肿这种疾病并不是特别的严重，是可以通过手术的方式治愈的，所以不用特别担心自己的身体情况。

其次，不孕，约30-70%子宫内膜异位症患者伴有不孕症，常因病变造成盆腔肿块、粘连、输卵管堵塞卵泡发育不好或排卵障碍等因素引起。患者常因盆腔器官粘连，使输卵管蠕动受阻或输卵管堵塞等机械因素导致不孕，亦可能为卵巢功能不全，自身免疫反映增强，前列腺素增加，泌乳素增高等因素有关。

最后，手术方式有开腹手术和经腹腔镜手术两种。腹腔镜手术是本病最佳处理方法。目前认为以腹腔镜确诊、手术+药物为内异症治疗的金标准。有条件的医院，腹腔镜手术应为内异症的首选治疗方法。但腹腔镜手术的选择及效果在很大程度取决于设备、器械和手术者的经验及技巧。开腹手术可用于腹腔镜条件不具备或非常复杂的手术，如严重粘连和有多次手术史者。