快递发货了还能申请退款。

处理方法如下：

1、联系快递公司，要求退回，这样不再多收第二次运费；

2、联系发件的网点，让对方在电脑上做一下退件处理，在件送达派送前，都是可以退回的；

3、在点击了退款选项上，会有一个选择，一是还没发货，二是已经发货，运费的承担问题需要和店家商量解决。