原因如下：

1、可可西里东部与西北部及长江源区的地理、气候条件不同。西部湖泊众多，是长江北源楚玛尔河的发源地区，大小河流纵横交错，植物生长不均匀。东部海拔较高，而三江源保护区的海拔相对较低，气候环境温暖舒适，母羚羊更喜欢生活在海拔相对较低的地方。因此，母羚羊为了明确的方向性宁愿长距离迁徙。

2、迁徙路线与河道有关，藏羚羊喜欢在楚玛尔河两岸活动。楚玛尔河横贯可可西里的中、北部，有近一半的河段在青藏公路以东，是一条季节性河流。

3、由于前些年西北部大量产羔期的藏羚羊被猎杀，迫使藏羚羊向东转移而越过公路去栖居。但青藏公路日渐密集的车辆形成一道流动屏障，藏羚羊很难穿越。除了采矿、采油等干扰外，2002年进青藏的建设人员就有10万左右。10年前格尔木还只是一个人类聚居点，而现在已是相当繁华的城市。人流的涌入或许并未充分考虑该地区的生态承受能力和对野生动物生存的影响。