主要存在以下区别：

1、基础菌类不同。普通酸奶的基础菌类是保加利亚乳杆菌和嗜热链球菌。烧酸奶的菌类为干酪乳杆菌；

2、工艺不同。普通酸奶一般为90度高温进行杀菌，杀菌时间大约为五分钟，并且会加入色素、焦糖等物质。烧酸奶的杀菌温度更高，杀菌时间更长，甚至可以达到几个小时，烧酸奶所形成的状态和颜色都是自然天成的，不添加任何添加剂；

3、价格不同。普通酸奶，制作工艺简单，价格便宜。烧酸奶经过的工艺流程更多，消耗的人力物力更大，所以价格也稍微偏高。