会。微波炉的杀菌能力主要来自于热力效应和生物效应。热力效应能使细菌的细胞蛋白质受热变性凝固，导致细菌死亡，牛奶加热的时间越长、温度越高，其中营养的流失就越严重。如果用微波炉加热牛奶时间过长，会使牛奶中的蛋白质受高温作用，由溶胶状态变成凝胶状态，导致沉积物出现，影响乳品质量。牛奶加热的时间越长、温度越高，其营养流失就越严重，其中维生素Ｃ流失得最厉害，其次是乳糖。

但是微波炉可以加热牛奶。但是需要将牛奶从原本容器（袋子、盒子等）中倒出来再进行加热。容器可以选择一个杯子或碗，由于每个微波炉的功率不同，所以加热时间也不一定相同，但要注意不要将牛奶加热至沸腾，这样会破坏牛奶中的一些营养成分，若是不清楚加热时间，可以先给牛奶加热一分钟，若是未能加热至理想温度再进行适当加热。