截止2018年4月，南昌工程学院共开设51个本科专业、14个专科专业。

包括水利水电工程、水土保持与荒漠化防治、园林、测绘工程、水文与水资源工程、农业水利工程、地质工程、 风景园林水利水电建筑工程、工程测量技术土木工程、城乡规划、给排水科学与工程、工程管理、道路桥梁与渡河工程、建筑学、应用电子技术、通信技术市场营销、旅游管理、电子商务、物流管理、财务管理、国际经济与贸易、保险学、审计学环境设计、广告设计、视觉传达设计、动画、产品设计、汉语言文学、音乐学、编辑出版学、广播电视新闻学、信息与计算科学、英语、翻译、法语商务英语土木工程、建筑工程技术、旅游管理、会计水利水电建筑工程、工程测量技术、道路桥梁工程技术、水电站动力设备与管理、应用电子技术、通信技术、机电一体化技术、电气自动化技术等专业。