孔姓与孟姓不能通婚的原因既有一般性，也有特殊性，具体原因如下：

1、一般性：同姓不婚。基于家族伦理和血缘关系。古代医学并不发达，古人并不了解同姓可以结婚。同时基于家族伦理、辈分制度，所以统一规定同姓不婚。

2、特殊性：孔子是首圣，孟子是亚圣 。 孔、曾、颜、孟在儒家道统上有师承或同窗关系，为了维护儒家道统的严肃性，因此规定相互之间不通婚，在古代是可以被理解和遵循的。