木霉菌和腐质酸叶面肥能混用，木霉菌与有机肥料混合处理可明显促进幼苗植株的生长。绿色木霉菌剂生物农药制剂可直接杀死作物根部和土壤中的根结线虫和地下害虫，能消灭耕层病菌及害虫，并改良土壤，破除板结，提高土壤通透性及根系供氧量，可抑制多种植物真菌病，研究最多的真菌是根腐病、立枯病、猝倒病、枯萎病等土传病害、灰霉菌、腐霉菌、丝核菌、炭疽菌、镰刀菌、菌核病。绿色木霉菌剂防治蔬菜根结线虫病的生物农药，还可以防治黄瓜等葫芦科、番茄等茄科蔬菜的根结线虫病害。绿色木霉菌剂生物农药通过产生抗生素、营养竞争、微寄生、细胞壁分解酵素、以及诱导植物产生抗性等机制。