牛奶变苦有两种原因：

1、纯牛奶味道发苦，是由于牛奶内含有的蛋白酶有机物引起，牛奶经超高温灭菌后，酶钝化，失活，但贮藏运输中如果经撞击，高温曝晒等外界刺激下，失活的耐热蛋白酶被激活，使牛奶中的部分蛋白质分解，产生一些苦味的 、胨、氨基酸等，导致牛奶变苦。

2、牛奶中含有酪蛋白,以胶体悬浮液状态存在于牛乳中，同时酪蛋白胶粒中含有镁离子，当牛奶受光照或较长时间在高温条件下，牛奶中的酸度会逐渐上升，随之酪蛋白中的钙、镁离子也游离出来，和牛奶中原有的氯根离子形成具有苦味物质的氯化钙、氯化镁等物质，从而导致牛奶变苦。