1、产权有所不同：安居房相对于商品房而言，产权上有明显的区别，大部分的安居房其实并不是完全产权，可以理解为具有完全的房屋权，却不一定具有完全的土地使用权。很多安居房的土地性质是划拨土地，也就是没有缴纳出让金。而商品房是有完全产权的，也就是具有完全的房屋权和完全的土地使用权，土地性质是出让土地，也就是缴纳了土地出让金。所以，安居房在以后再次交易时，可能需要补缴土地出让金。

2、房屋质量不同：商品房的质量一般都不会存在什么大的问题，但是由于安居房的建筑利润受到限制，所以建筑商人通常偷工减料，通过这些操作来增加自身的利润。因此，安居房的房屋质量一般相对较差一些。

3、价格不同：安居房是党和国家安排贷款和地方自知自筹资金建设的面向广大中低收家庭，特别是对4平方米以下特困户提供的销售价格低于成本、由政府补贴的非盈利性住房，所以安居房的价格会比商品房的价格低很多。

4、交易受时间的限制：安居房的交易受到的限制比较多，很多安居房在交易年限上都有很大的限制，安安居房一般规定在5年或者10年内不得进行上市转售。商品房则没有这方面的规定，只要是买到的是已经办理过登记的现房，那么就可以上市交易，转手买卖了。但是商品房是期房的话，法律上是不允许转售的。

此外，由于安居房存在的很多的交易限制，购买安居房的风险相对于购买商品房而言就会大一些。