公建产权与商业房产的区别如下：

1、归属不同：

公建产权一般基于社会公共利益，归国家政府及全体业主所有。国家和地方规定，从社会公共利益出发，规定开发商建造一套完整的房屋，要明确产权归属，按照国家和地方政府的有关规定执行。而商业房产的产权原则上归开发商。

2、范围不同：

公建产权房包括配套中小学校，配套物业管理办公用房、社区居委会用房、配套防空地下室等。商业房产一般指住宅区。就建筑性质而言，商业房产不属于城市规划管理界定的配套公建的范畴，但由于开发商往往把不同类型的公建产权房集中在会所修建，于是会所往往又与公建产权联系在一起。

3、产权不同：

公建产权属于全体业主。商业商品房公用建筑面积分摊是按栋进行的，其产权属于开发商。