商业用房有房产证，可以办理。

商业用房如理房产证流程如下：

1、办理初始登记，开发商办理初始登记是自己办理房产证流程的必要前提条件。根据《商品房销售管理办法》第34条的规定，房地产开发企业应当在商品房交付使用之日起60日内，将其办理房产证所需材料报送房屋所在地房地产主管部门。

2、办理好初始登记后填写申请表，申请表填写完需要开发商签字盖章。有的开发商手中会有现成的盖好章的表格，只需到开发商处领取并填写即可。

3、拿会测图或表，由于测绘表是登记部门确定房产证上标注面积的重要依据，因此是必需的材料之一。可以到开发商指定的房屋面积计量站申请并领取测绘表，或者带身份证直接到开发商处领取，也可以向登记部门申请对房屋面积进行测绘。

4、领取相关证件。在前面询问相关部门时，一定要明确需要领取哪些必要的申请文件，一次齐全。

5、领取房产证。