到市场上买到适宜的消毒清洁剂。接着取一大盆水，再往里面加入适量消毒清洁剂，再用泡在里面的抹布对马桶垫进行擦洗即可。接着用水冲洗马桶垫后，进行晾干步骤。

假若马桶垫的材料是布质的，则可以选择在阳光下进行曝晒：但是像胶质的马桶垫，则需要放在通风处进行阴干。或者在其表面用医用酒精擦拭，也难增强消毒效果。定期清洗的间隔时间不宜超过一个星期，一般2-3天清洗一次是最佳的，假若家中马桶有外人使用则可以选择当天清洗。