工程质量事故鉴定的方法有：

1、司法鉴定必须交由法定部门进行;

2、当事人如在合同中约定鉴定单位的应从其约定;

3、紧急情况下应及时委托鉴定部门作出鉴定结论。

【法律依据】

《生产安全事故报告和调查处理条例》第二十七条规定，事故调查中需要进行技术鉴定的，事故调查组应当委托具有国家规定资质的单位进行技术鉴定。必要时，事故调查组可以直接组织专家进行技术鉴定。技术鉴定所需时间不计入事故调查期限。