1、两者的加工方法不同。巴氏牛奶是以新鲜牛奶为原料，采用巴氏杀菌法加工而成的牛奶。普通牛奶是从雌性奶牛身上所挤出来的加工而成的奶；

2、两者的工序不同。巴氏牛奶是采用72到85摄氏度左右的高温杀菌，经过离心净乳，标准化，均质，杀菌和冷却，以液体状态灌状，直接供给消费者饮用的商品乳，而普通牛奶是将新挤出的牛奶经过均质杀菌后，可直接饮用；

3、两者的营养不同。普通牛奶相较于巴氏牛奶，巴氏牛奶的营养高。巴氏牛奶在杀灭牛奶中有害菌群的同时完好地保存了营养物质和纯正口感。