毛霉菌分对人无害，毛霉常被应用于腐乳，毛豆腐等发酵工艺，可以产生蛋白酶、脂肪酶等酶系，赋予食物更好的风味和营养。毛霉菌感染的药物治疗应选择两性霉素B，若累及中枢神经系统或鼻窦，可考虑手术干预以降低病死率。毛霉的用途很广，常出现在酒药中，能糖化淀粉并能生成少量乙醇，产生蛋白酶，有分解大豆蛋白的能力，我国多用来做豆腐乳、豆豉。许多毛霉能产生草酸、乳酸、琥珀酸及甘油等，有的毛霉能产生脂肪酶、果胶酶、凝乳酶等。常用的毛霉主要有鲁氏毛霉和总状毛霉。腐生，广泛分布于酒曲、植物残体、腐败有机物、动物粪便和土壤中。有重要工业应用，如利用其淀粉酶制曲、酿酒；利用其蛋白酶以酿制腐乳、豆豉等。代表种如总状毛霉（M.racemosus）、高大毛霉（M.mucedo）、鲁氏毛霉（M.rouxianus）等。