第一，藿香正气液对于胃肠蠕动推进和抑制作用：藿香正气液可以改善外感风寒、内伤湿滞所致的胃肠功能紊乱。

第二，肠屏障功能保护作用。藿香正气液, 可促进病人胃肠功能恢复, 尽早恢复肠内营养支持, 从而降低感染、电解质紊乱等并发症。

第三，抗病毒抗菌作用。藿香正气液对大肠杆菌和痢疾杆菌I型的最低抑菌浓度为6.95mg/ml，对金黄色葡萄球菌、痢疾杆菌II型、链球菌的最低抑菌浓度为13.9mg/ml，其作用强于藿香正气水和合剂。