公司在员工发放工资的时候，由公司财务部门根据人事部门出具的收入表、保险费、公积金扣款等信息以及当月应交个人所得税。个人所得税以“应交税金-应交个人所得税”贷方发生的形式入账。次月，公司根据税法规定，在地税申报网站上，将上月代扣在账面的工资个税做纳税申报。