祝姓的来源为出自姬姓、出自己姓、以官职为姓、出自他族改姓。

1、出自姬姓：为黄帝之裔。据《元和姓纂》《新唐书·宰相世系表》等所载，黄帝之后，周武王封其于祝（故城在今山东省长清东北祝阿故城），后来就有了祝国，子孙以地为氏。

2、出自己姓：祝融之后。据《元和姓纂》所载，祝融之后有以官职命姓者。远古时候有位火神叫祝融，是一位氏族首领。

3、以官职为姓：据《姓谱》《路史》所载，古有巫史祝祀之官，其子孙以官为氏。又远古时，巫师有很高的社会地位，官职很高，称为巫史，或者称为祝史。远古时以官职为姓的习惯，祝史的后代，往往继承官职，并世代姓祝。

4、出自他族改姓：据《通志·氏族略》所载，北魏叱卢（吐缶）氏之后有祝姓；清朝满洲八旗姓爱新觉罗氏、喜塔喇氏等之后均有改姓祝者；傈僳族以竹为图腾的麻打息氏族汉姓为祝；今满、瑶、彝、土家、蒙古等民族均有此姓。