因为生番茄里含有果胶元，果胶元是一种胶状物质，对水的溶解度不大，因此果胶元中的有机酸溶到果汁中的数量不多，酸味不显著。如果将番茄煮熟以后，果胶元就变成了溶解于水的果胶，有机酸也跟着跑到水里，吃起来就显得酸些。特别是由于果胶元在盐水中的溶解度更大，所以，煮番茄时，如果先放盐，味道就更酸。

番茄中还含有一种对酸性起缓冲作用的蛋白质，蛋白质受热会凝固，盐却能使蛋白质发生沉淀，这样就使它失去缓冲作用，而增加了番茄的酸性。