被瓦剌军俘获的明朝皇帝是明英宗朱祁镇；

明英宗朱祁镇，汉族，明宣宗朱瞻基长子，明代宗朱祁钰异母兄，明宪宗朱见深之父，朱祁镇是明朝第六位皇帝，第一次，年仅九岁，继位称帝，年号正统，国事全由太皇太后张氏把持，贤臣三杨主政，随之，张氏驾崩，三杨去位，宠信太监王振，导致宦官专权，正统14年，土木堡之变，被瓦剌俘虏，其弟郕王朱祁钰登基称帝，遥尊英宗为太上皇，改元景泰，瓦剌无奈之下，释放英宗，随即，景泰帝将他软禁于南宫七年，景泰八年，石亨等人发动夺门之变，英宗复位称帝，改元天顺，天顺八年病逝。