虹吸式马桶的工作原理是：在装置中管内最高点液体在重力作用下往低位管口处移动，在U型管内部产生负压，高位管口的液体被吸进最高点，从而使液体源源不断地流入低位置容器。

现在市场上的座便器的冲水原理基本是直冲式和虹吸式两种大类。虹吸式中又分旋涡式虹吸和喷射式虹吸。

虹吸式马桶的优点是冲水噪音小，容易冲掉黏附在马桶表面的脏物；缺点是池底存水面积增大，浪费水。