分子有能量，但没有内能的概念，内能是个宏观概念，是物体中所有分子无规则运动的动能和分子间相互作用势能的总和，化学中内能还要包括分子内部的能量。一个分子具有动能，两个分子或更多分子间存在相互作用势能，分子内部还有电子和原子核的作用势能，电子间的作用势能，电子动能，原子核间的作用势能等。