指令编码方式有三种：直接表示法，编码表示法，混合表示法。

1、直接表示法是将每个控制信号都作为微指令中的一个位，这种方法的特点是简单直观，其输出直接用于控制，但编码效率低；

2、编码表示法是将微指令进行分组编码，将不同时出现的相斥信号分在一个组中，然后将其编码成较短的代码，这种方法减少了控制存储器所需要的存储器的代码的数量，但是编码的指令代码需要译码器译码，增加了控制信号的延迟，影响CPU的工作频率；

3、混合表示法是把直接表示法与编码方法相结合使用，即采用部分直接表示部分编码的方法，将一些速度要求较高，或与其他控制信号都相容的控制信号以直接方式表示，而将剩余信号以编码方式，混合表示法便于综合考虑指令字长，灵活性和执行速度方面的要素。