三间鼠鱼可以和灯鱼、短鲷、七彩和神仙混养，灯鱼与鼠鱼的活动区域不冲突，且性情温顺；七彩和神仙色泽艳丽、体态优美，与三间鼠鱼有着共通的水质环境要求；短鲷与鼠鱼搭配也没有水质环境要求上的冲突，不过注意三间鼠鱼的繁殖缸里不能混养短雕。

可以和三间鼠鱼混养的鱼灯鱼可以和三间鼠鱼混养，它们属上层鱼，多在鱼缸中上层活动，与鼠鱼的活动区域不冲突，不会影响鼠鱼的正常活动，而且灯鱼性情温顺，对鼠鱼没有伤害能力。

七彩和神仙与鼠鱼也能混养，二者混养能充分发挥了七彩色泽艳丽、神仙体态优美的特点，并且它们都是南美物种，水质环境要求也有共通性。

短鲷也可以和三间鼠鱼混养，它们主要出自南美流域，因此与鼠鱼搭配没有水质环境要求上的冲突。不过，短鲷会吃鼠鱼的鱼卵和幼鱼，所以繁殖缸里不能混养短雕。