酶工程指的是将生物酶的特殊的催化性能应用到工业催化上去，如利用果糖转化酶将葡萄糖转化为果糖。

蛋白质工程指的是将天然蛋白质结构进行改造，即对蛋白质进行改性，得到满足人类需求的具有新型特殊功能的蛋白质。如对天然丝、皮革的加工等等。