花呗分期付款，系统会扣除商品的总金额，因为花呗属于一种“先消费，后还款”的全新支付方式，扣全额扣的是花呗额度，用户还款只需根据花呗每期账单足额还款即可。

所以使用花呗分期时，需确保花呗可用额度大于或等于分期付款总金额，否则分期不成功。