祁连山中段林区是以山地草原为主体，山地森林、高山草甸和岩石裸地大面积广泛分布，农田、居民地、工矿用地、水体小面积零散分布，河流廊道贯串各景观。

祁连山脉位于中国青海省东北部与甘肃省西部边境，由多条西北东南走向的平行山脉和宽谷组成。因位于河西走廊南侧，又名南山。西端在当金山口与阿尔金山脉相接。东端至黄河谷地，与秦岭、六盘山相连，长近1000千米，属褶皱断块山。最宽处在酒泉市与柴达木盆地之间，达300千米。自北而南，包括大雪山、托来山、托来南山、野马南山、疏勒南山、党河南山、土尔根达坂山、柴达木山和宗务隆山。山峰多海拔4000米到5000米，最高峰疏勒南山的团结峰海拔5808米。海拔4000米以上的山峰终年积雪，山间谷地也在海拔3000米到3500米之间。