机械电子工程需要掌握多款软件，列举三个如下：

1、ANESIM：多学科领域的复杂系统建模与仿真平台。

2、MATLAB：美国MathWorks公司出品的商业数学软件，用于算法开发、数据可视化、数据分析以及数值计算的高级技术计算语言和交互式环境。

3、ANSYS软件：美国ANSYS公司研制的大型通用有限元分析软件，是世界范围内增长最快的计算机辅助工程软件，能与多数计算机辅助设计软件接口，实现数据的共享和交换。