对生物的分类经历了四界,五界，六界的过程。

现在普遍认为可以分为六界。病毒界、原核生物界、真核原生生物界、真菌界、植物界、动物界。微生物包括原核生物界。真核原生生物界以及真菌界。需要注意的是病毒不属于微生物界。