它们的差异主要体现在化学成份不同上，也就是它们是由不同元素组成。

锆石：主要化学成分为硅酸锆，晶体属四方晶系的岛状结构硅酸盐矿物，晶体呈短柱状，通常为四方柱、四方双锥或复四方双锥的聚形，锆石颜色多样，有无色、紫红、金黄色、淡黄色、石榴红、橄榄绿，香槟，粉红，紫蓝，苹果绿等，一般有无色、蓝色和红色品种，光泽为强玻璃光泽至金刚光泽；莫桑石：它是碳化硅的一种，颜色有无色、蓝、绿、黄绿、黄色，多为暗绿色、黑色，具有与钻石相同的金刚光泽。