“独立之精神，自由之思想”有以下两点意思：

1、精神上要独立，做到耻不如人，即以不如人为耻，从而发奋图强；

2、思想上要自由，做到讲究科学、重视实干，即用科学的思想代替封建不自由的固步不前的旧思想，重视积累实干经验。

“独立之精神，自由之思想”是陈寅恪先生题写在《清华大学王观堂先生纪念碑铭》中的十个大字，这十个大字也永远铭刻在包括许倬云先生在内的一批台湾地区知识分子的心中。