同济大学第二附属中学是同济大学和普陀区委区政府合作创办的一所全日制公办完全中学，在撤并原普陀中学和长寿中学的基础上于2002年6月筹建，2003年6月正式挂牌。学校占地面积58亩，分为南北两个校区。建校以来，同济二附中依托同济品牌，主动创新发展，弘扬“同舟共济、自强不息”的学校精神；坚持“科技与人文和谐发展”的办学理念；探索“生态课程，和谐教育”特色课程，致力于追求培养具有“科技创新和国际视野”的人才。2007年被评为普陀区实验性示范性高中，2015年成为上海市普通高中特色建设项目学校。

学校先后获得“联合国教科文组织中国可持续发展项目实验学校”、“全国创造教育实验基地学校”、“上海市文明单位”、“普陀区实验性示范性高中”等60多项荣誉称号，成为普陀区优质教育资源。