身体背腹扁平；左右对称（两侧对称）；体壁具有三胚层；有梯状神经系统（在前端有发达的脑，自脑向后并有若干纵行的神经索，各神经索之间尚有横神经相联，形成了梯状结构）；无体腔，有口无肛门。由于扁形动物出现了中胚层，中胚层可以分化形成肌肉层。

本门动物可以分为以下3个纲：1、涡虫纲：是扁形动物中最原始的类群，体表被纤毛，肠道较发达，体长5mm至60cm，已知约4000种，多数营自由生活。海洋生活的如旋涡虫；淡水中生活的如真涡虫Dugesia（Euplanaria）；少数种类在陆地潮湿土中生活如土笄蛭涡虫。

2、吸虫纲：成虫体表无纤毛，肠道较简单，通常有口吸盘和腹吸盘等吸附器官。已知约6千种，均营寄生生活，生活史复杂，包含1～2个中间宿主。如寄生在人体门静脉内的日本血吸虫，给人体以极大的危害，此外尚有寄生在人体肝脏的华枝睾吸虫；寄生在人体肺内的魏氏并殖吸虫等。

3、绦虫纲：成虫体表无纤毛，消化系统包括口和肠等全部退化消失，成虫一般作长带状，由多数节片组成，有吸盘和钩等附着器官，已知约有3千4百种，全为营体内寄生生活，寄生在脊椎动物的肠道等器官内，为高度营寄生生活的类群。如猪带绦虫和牛带绦虫。