矿泉水中含有微生物，但是对人体无害。微生物无处不在，但不是所有都对人体都有害。人的肠道中有许多微生物是帮助人体消化的。微生物包括：细菌、真菌以及一些小型的原生生物、显微藻类等一大类生物群体以及病毒，个体微小、种类繁多，与人类关系密切。涵盖有益跟有害的众多种类，广泛涉及食品、医药、工农业、环保等诸多领域。

微生物的分类：1、真核细胞型微生物：细胞核的分化程度较高，有核膜、核仁和染色体，胞质内有完整的细胞器。真菌属于此类型微生物。

2、原核细胞型微生物：细胞核分化程度低，仅有原始核质，没有核膜与核仁，细胞器不完善。这类微生物种类众多，有细菌、螺旋体、支原体、立克次体、衣原体和放线菌等。

3、非细胞型微生物：没有典型的细胞结构，亦无产生能量的酶系统，只能在活细胞内生长繁殖。病毒属于此类型微生物。