金鱼的腮位于口咽腔两侧，由鳃弓、鳃耙、鳃丝组成。每一条鳃的两侧又生出许多突起为鳃小片，能增大与水的接触面，提高气体交换效率，中间分布的大量微血管，是血液与水环境进行气体交换的场所。当水由金鱼口进入流经鳃，然后经鳃盖后缘流出，水流经过鳃丝时，水中的溶解氧进入鳃丝的毛细血管中，而二氧化碳由鳃丝排放到水中，二者进行气体交换，金鱼进行呼吸。