司法鉴定间接损失的方法是：

1、确定鉴定范围。司法鉴定人就鉴定范围与事故双方进行沟通，确定损失构成对直接损失和间接损失做出划分；

2、现场取证。司法鉴定人与处理事故双方代表人一同到现场察看收集证据；

3、收集证据材料；

4、价值分析。

【法律依据】

根据《司法鉴定程序通则》第四条，司法鉴定机构和司法鉴定人进行司法鉴定活动，应当遵守法律、法规、规章，遵守职业道德和执业纪律，尊重科学，遵守技术操作规范。