1、双子叶植物多为直根系，单子叶植物多为须根系。

2、初生结构的差异：

表皮层：在暴露于地面部分，有可能在外壁发生角质化，甚至引起整个细胞壁的木栓化或木质化。

皮层：单子叶外皮层除薄壁细胞外，偶有木质纤维。单子叶内皮层除靠近导管的通过细胞外，其余细胞不仅半径向侧壁木栓化或木质化，而且切线 向内侧壁，甚至整个细胞壁皆木栓化或木质化增厚。

中柱：单子叶织物初生木质部起源较多，常达8到30余出，髓部极其发达明显。中柱鞘及其内的一切薄壁组织都没有恢复分生能力，不能转化成为形成层。

3、次生结构：根的次生生长仅存在于裸子植物和双子叶植物中

4、双子叶植物中的一些种类特有一类三生构造，根的异形构造：皮层中有新形成层环的不断产生，并形成新的异型维管束。