磁共振检查原理是自旋的原子核在磁场中与电磁波互相作用的一种物理现象，用在医学方面主要是利用原子核即氢质子在人体内经过磁场的作用不同排列而产生的一种现象，因为是磁场没有辐射，所以磁共振的检查是比较安全的。

CT是用X线束对人体检查部位一定厚度的层面进行扫描的技术，因为X线，所以就是辐射，但是CT操作是在正常范围之内，所以辐射剂量也是在正常范围之内。

磁共振和CT的区别主要是磁共振没有辐射，CT有辐射。