1921年，江西公立医学专门学校成立，为南昌大学医学院前身，何焕奎任首任校长。

1952年，教育部根据以“培养工业建设和师资为重点，发展专门学院，整顿和加强综合性大学”的方针，开始大规模的院系调整。

1958年，江西工学院和江西大学成立，1962年江西师院生物系并入江西大学。

1985年江西工学院更名为江西工业大学，江西大学和江西共青垦殖场联合创办了江西大学共青学院。

1993年江西大学与江西工业大学合并组建成新的南昌大学，同年成为江西省第一个博士授予单位。

1997年，南昌大学正式列入国家“211”工程重点建设大学。

2002年12月29日，南昌大学前湖校区奠基。

2005年，南昌大学与江西医学院正式合并组建新南昌大学。

2008年10月6日，南昌大学太阳能光伏学院成立，是中国第一所在大学设立的光伏学院。

2017年9月，入选国家首批“双一流”世界一流学科建设高校。