1、兵部只处理国家军队的日常事务，军队费用的调拨，人员的安置，兵员的征召等，也处理一些战争计划的制定；枢密院是军队的最高指挥机构，军队的调防，战争的动员，战争的指挥等都是枢密院的职责，同时也领导兵部的工作；

2、兵籍司掌士兵征募、抚恤、迁补、退役等人事；枢密院侍卫司掌侍卫事务；

3、兵部下有三衙：殿前都指挥使司、侍卫亲军马军都指挥使司、侍卫亲军步军都指挥使司；凡军国战和攻守之策，由皇帝和政事堂共同决策，枢密院会提供建议供参考，最终方案也由枢密院提出，让皇帝选择采纳；

4、兵部库部司掌军资料账，还要研发军用器械；枢密院职方馆掌管地图测绘、军机档案和情报收集；

5、兵部职方司掌国内地图测绘和国内情报机构，烽火和城隍要寨等修筑，测绘的要上报职方馆；枢密院检阅司掌督察三衙训练，发布演习命令等。