办理边防通行证需要不同地点的签证盖章，流程及要去的部门如下:

1、先去户口所在地的派出所，拿一张边防证办理的申请表。

2、自己填写个人资料，最重要的是具体写明将要到达哪个地区，让单位保卫科写意见，盖印章。

3、拿回户口所在地派出所，盖印章。

4、到户口所在地管辖区的公安分局边防证办理处办理边防证。

5、办证全程需要个人身份证及户口本，以及免冠大一寸相片二张。