两所大学都是名校。在上海乃至华东地区，同济大学名气比厦门大学大。在厦门和江西等地，厦门大学名气大于同济大学。

厦门大学一级学科国家重点学科有五个，分别为理论经济学、应用经济学、化学、海洋科学、工商管理。二级学科国家重点学科有九个，分别为国际法学、高等教育学、专门史、基础数学、凝聚态物理、动物学、水生生物学、细胞生物学、环境科学。

同济大学是中华人民共和国教育部直属，由教育部和上海市共建的全国重点大学，是历史悠久、享有盛誉的中国著名高等学府，是国家“211工程”、“985工程”重点建设高校，也是收生标准最严格的中国大学之一。同济大学工科专业特色显著，排名靠前的专业为土木工程，城乡规划学，风景园林学，建筑学，交通运输工程。