扇贝外表的纹路藏有较多泥沙，可以用硬刷子在流水下刷洗干净，再用淡盐水浸泡，让其吐尽泥沙。扇贝洗净后将壳撬开或焯烫至壳自动打开，再将贝柱旁的黑色部分(即内脏)摘掉丢弃。壳紧闭的扇贝久煮不开口，说明已经死掉，不建议食用。

扇贝的可食部分是白色的闭壳肌、片状呈红色或白色的生殖腺和裙边，黑色的消化腺和鳃结构均不能食用。

扇贝的消化腺相当于动物的下水，含有排泄的废物、毒素、重金属或泥沙，最好在烹饪前去掉，以免污染其它可食部分。注意扇贝的可食部分必须充分煮熟，不能生吃。