新鲜的黄花菜一般建议洗净焯水后再进行烹煮食用。新鲜的黄花菜中一般含有一种名为“秋水仙减”的毒素，这种毒素在摄入过量的情况下一般会引发人体中毒症状，主要症状多为恶心呕吐、腹痛等。

新鲜的黄花菜中的毒素主要是呈碱性，这种碱性毒素是不耐高温的，一般经过焯水或高温的烹煮会让其减弱或消失。

新鲜的黄花菜可以通过制成菜干的方式进行食用，鲜黄花菜的毒素具有较好的水溶性，在经过焯水后铺开晒干，一般可以去掉毒素，同时菜干会更有利于保存。