原子晶体是由原子通过共价键相互成键形成的晶体，分子晶体是由分子堆叠形成的晶体。【分子晶体是分子间通过分子间作用力（包括范德华力和氢键）构成的晶体】。这就决定了它们之间的差异：

1、原子晶体熔沸点一般较高；

2、典型的原子晶体一般有相对高的硬度（相对于分子晶体）。

能否找到单个分子是原子晶体跟分子晶体的根本差别：比如石英（二氧化硅）；原子晶体；干冰（二氧化碳）；分子晶体等。