从外观上两者的屋顶不同进行区分，教堂的屋顶有十字架造型，清真寺的屋顶有星月造型。

教堂是基督教举行弥撒礼拜等宗教事宜的地方，按照级别分类有主教坐堂，大教堂，教堂，礼拜堂等。欧洲的教堂大致分为四种建筑风格：罗马风格、哥特风格、巴洛克风格和现代主义教堂。

清真寺，也称礼拜寺，是伊斯兰教穆斯林礼拜的地方，词根为“拜倒”的意思，因为穆斯林礼拜时需要拜倒叩拜。清真寺是伊斯兰教建筑群体的型制之一 ，是穆斯林举行礼拜、举行宗教功课、举办宗教教育和宣教等活动的中心场所。