替硝唑与甲硝唑的区别是替硝唑主要特点是起效快，作用强，维持疗效时间长，疗程短，而且副作用比甲硝唑小。甲硝唑，替硝唑，这两种药物的作用基本相似，主要用于治疗厌氧菌引起的感染性疾病，对滴虫病和阿米巴原虫病也有效。