酶的高效性是和非酶的催化剂比较而言。主要是指催化能力，蛋白质（环境适宜）的催化能力是普通化学催化物质的15到18倍。 生物分子之间的反应首先要进行分子碰撞接触，如果在没有酶作用的情况下，分子主要靠自然的热运动来随机进行接触，这样的几率比较小，而在酶的作用下，由于酶和作用底物有特异性结合位点，相当于把反应需要的分子给拉到一起去了，所以这样的效率要高很多。特异性的问题，是由于分子的空间结构不同，酶的结合位点的空间结构和底物的分子结构相契合，而和别的不相干的分子不能结合。