微生物的度量单位一般是菌落形成单位，菌落形成单位指单位体积中的活菌个数。在活菌培养计数时，由单个菌体或聚集成团的多个菌体在固体培养基上生长繁殖所形成的集落，称为菌落形成单位，以其表达活菌的数量。菌落形成单位的计量方式与一般的计数方式不同，一般直接在显微镜下计算细菌数量会将活与死的细菌全部算入，但是菌落形成单位只计算活的细菌。

微生物是包括细菌,病毒,真菌以及一些小型的原生动物等在内的一大类生物群体,它个体微小,却与人类生活密切相关。